La piazza è una testimonianza importante della storia fluviale di Pisa. La sua caratteristica principale è quella di ricevere, attraverso un passaggio nelle mura, l’acqua del fiume Serchio tramite il Fosso del Mulino, proveniente da Ripafratta. Le acque del fosso confluiscono in un piccolo bacino anticamente conosciuto come il “Porto delle Gondole” che serviva per attraccare con piccole imbarcazioni e risalire il fosso fino ai Bagni di Pisa, oggi San Giuliano Terme, per villeggiatura e cure termali. La Piazza delle Gondole era il punto di arrivo dell’Acquedotto Mediceo.